Am 5. Mai 1996 scheiterte mit der geplanten Fusion von Berlin und Brandenburg eines der ambitioniertesten Projekte von Manfred Stolpe: 36,2 Prozent der Brandenburger stimmten für, 63,1 Prozent gegen den Zusammenschluss, während in Berlin eine knappe Mehrheit für die Länderehe votierte. Rückblickend macht Stolpe hauptsächlich den Zeitpunkt der Volksabstimmung für die Niederlage verantwortlich. Einen Zusammenschluss der beiden Länder hält er auch heute noch für sinnvoll.