Als in der Nacht zum 13. August 1961 die Berliner Mauer errichtet wurde, wohnte Manfred Stolpe in Potsdam. Wie bei den meisten Zeitgenossen herrschte auch bei ihm zunächst große Ratlosigkeit - und die Furcht vor einer militärischen Eskalation. Der Mauerbau hatte erhebliche Auswirkungen auf die Tätigkeit der zu diesem Zeitpunkt noch nicht zwischen Ost- und Westdeutschland getrennten Kirchen.

1962 führte die DDR die allgemeine Wehrpflicht ein. Eine Möglichkeit, den 18-monatigen Kriegsdienst zu verweigern, war zunächst nicht vorgesehen. Vor allem durch Druck aus kirchlichen Kreisen wurde 1964 dann die Möglichkeit eingeführt, den Wehrdienst bei den Baueinheiten der Nationalen Volksarmee (NVA) - und damit unbewaffnet - abzuleisten. 

Nach den Landtagswahlen im September 1999 brauchte Manfred Stolpe einen Koalitionspartner. Während Regine Hildebrandt eine Zusammenarbeit mit der SED-Nachfolgepartei PDS bevorzugte, entschied sich Stolpe für ein Bündnis mit der von Jörg Schönbohm geführten CDU. Hildebrandt verließ daraufhin aus Protest die Regierung, auch das persönliche Verhältnis der beiden nahm Schaden.

1992 wurden Manfred Stolpes Beziehungen zur Staatssicherheit der DDR öffentlich. Das Landesparlament in Potsdam setzte einen parlamentarischen Untersuchungsausschuss ein. Die Evangelische Kirche in Berlin-Brandenburg führte ein Vorermittlungsverfahren durch. 

Seit 2012 leben Ingrid und Manfred Stolpe in einem Alterswohnsitz in Potsdam. Neben einzelnen öffentlichen Auftritten und verschiedenen Ehrenämtern widmete sich das Ehepaar in den vergangenen Jahren verstärkt kulturellen Angeboten - und den ebenfalls in Potsdam lebenden Enkelkindern.  

In den Abendstunden des 9. Novembers fiel die Berliner Mauer - nach 28 Jahren. Die Öffnung der deutsch-deutschen Grenze machte den Erfolg der friedlichen Revolution in der DDR deutlich. 

1968 blühte in der Tschechoslowakei für kurze Zeit die Hoffnung auf, dass politische Reformen möglich wären. Truppen des Warschauer Paktes beendeten diesen Traum. Manfred Stolpe war zu diesem Zeitpunkt Leiter der Geschäftsstelle der Konferenz der Evangelischen Kirchenleitungen in der DDR.  

Als ehemaliger Landesvater hat Manfred Stolpe einen besonderen Blick auf die Brandenburger. Unermüdlich versuchte er, den Zusammenhalt der Brandenburger zu stärken. Die Brandenburger ihrerseits würdigten Stolpes Engagement für ihr Land und wählten ihn drei Mal zu ihrem Ministerpräsidenten. Bei den Landtagswahlen 1994 erreichte die SPD unter seiner Führung die absolute Mehrheit und konnte bis 1999 ohne Koalitionspartner regieren. 

Eng verbunden mit Manfred Stolpes Zeit als Bundesverkehrsminister ist die für den Sommer 2003 geplante Einführung der LKW-Maut. Die von Spott und Kritik begleitete Debatte wurde für Stolpe nicht nur politisch zum Problem: Da er um seine politische Handlungsfähigkeit fürchtete, verschob er die Behandlung seiner Krebserkrankung bis in den Sommer 2005.

Auch in Ungarn wurden politische Veränderungen niedergeschlagen. Manfred Stolpe war Jura-Student in Jena. Er gehörte zu einer kleinen Gruppe von Studenten, die sich weigerten, der SED beizutreten und daher unter staatlicher Beobachtung standen. 

In unterschiedlichen Kirchenämtern führte Manfred Stolpe seit Anfang der Sechzigerjahre unzählige Gespräche mit staatlichen Institutionen. In schwierigen Fällen auch mit der Staatssicherheit. In der Nachbetrachtung ist er sich sicher, dass er die Lage stets im Griff gehabt hätte - ihm jedoch eine gewisse Selbstüberschätzung attestiert worden sei. 

Manfred Stolpe beschreibt seine Rolle im Herbst 1989 als "Begleiter, ein Förderer, eine Art Sanitäter für den Katastrophenfall". Er habe vor allem darauf geachtet, dass die Kirchen ein "vor staatlichem Zugriff geschützter Raum" blieben, so wie es 1978 vereinbart worden war. Durch diese Zusicherung war es den zahlreichen kirchlichen "Gruppen" erst möglich geworden, ihre oppositionellen Tätigkeiten zu entfalten. Im Laufe des Jahres 1989 wurden Demonstrationen gegen die DDR-Staatsführung Woche für Woche größer und die Auseinandersetzungen heftiger.

Monate nach dem Fall der Mauer entschied sich Manfred Stolpe für eine politische Karriere. Elf Tage nach der Wiedervereinigung am 3. Oktober 1990 fanden in Brandenburg Landtagswahlen statt, aus denen die SPD mit ihrem Spitzenkandidaten Manfred Stolpe als Sieger hervorging. Am 1. November 1990 wurde Manfred Stolpe von einer Koalition aus SPD, FDP und Bündnis 90 zum ersten Ministerpräsidenten des wieder gegründeten Landes Brandenburg gewählt. 

Am 5. Mai 1996 scheiterte mit der geplanten Fusion von Berlin und Brandenburg eines der ambitioniertesten Projekte von Manfred Stolpe: 36,2 Prozent der Brandenburger stimmten für, 63,1 Prozent gegen den Zusammenschluss, während in Berlin eine knappe Mehrheit für die Länderehe votierte. Rückblickend macht Stolpe hauptsächlich den Zeitpunkt der Volksabstimmung für die Niederlage verantwortlich. Einen Zusammenschluss der beiden Länder hält er auch heute noch für sinnvoll.

Oskar Brüsewitz war ein evangelischer Pfarrer, der die kommunistische Unterdrückung der Kirchen anprangerte, indem er sich 1976 öffentlich in Zeitz verbrannte. Die Medien in der DDR stellten Brüsewitz’ Signal als Tat eines Psychopathen dar. Brüsewitz’ Tat löste eine DDR-weite Solidarisierung aus. Die Protestaktion des Oskar Brüsewitz wird auch als das "Fanal von Zeitz" bezeichnet. 

Ende des Jahres 2001 beschloss Manfred Stolpe, sich aus der Landespolitik zurückzuziehen. Auf einem SPD-Parteitag im Juni 2002 wurde Matthias Platzeck als neuer Ministerpräsident des Landes Brandenburg der Öffentlichkeit vorgestellt. Umso größer war die Überraschung, als Bundeskanzler Gerhard Schröder (SPD) ihn nach der Bundestagswahl im Herbst 2002 als seinen neuen Minister für Verkehr, Bau- und Wohnungswesen vorstellte.